ARVO中国之声|减法GWAS揭示POAG非IOP依赖机制的遗传结构

  • 2023-04-26 17:59:17
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编者按:

原发性开角型青光眼(POAG)是眼压(IOP)和非眼压依赖性机制共同作用的结果。尽管关于IOP的全基因组关联分析(GWAS)很普遍,但眼科学者们目前对除IOP以外影响POAG性状的遗传结构知之甚少。在本次ARVO会上,广东省人民医院的Yu Huang分享了团队的研究成果,该研究从POAG中减去IOP的遗传效应,以此研究POAG中剩余的非IOP依赖性机制的遗传结构。


非IOP依赖性机制常与视网膜血管形态相关

研究者使用基因组结构方程建模,评估单核苷酸多态性(SNP)与POAG变异的相关性,该变异独立于IOP,然后进行GWAS后分析。研究者构建了两个遗传风险评分(GRSs),分别代表IOP和非IOP依赖性机制,探讨了它们与泛视网膜血管形态特征(RVF)的关系。研究发现,POAG中非IOP依赖性机制的GWAS包含来自6个领先区域的15个显著的独立SNPs,总遗传率为2.1%。位于9号和14号染色体上的SNPs复制了先前在正常眼压性青光眼(NTG)上的GWAS,而其余4个区域rs80233695(编码ANAPC1)、rs12208086(编码STK38-SRSF3)、rs7803764(编码TMEM196)和rs2667477(编码RP11-384P14.1)未被报道为NTG的显著区域。与IOP依赖性机制相比,非IOP依赖机制与光学形态的遗传相关性更强,视杯面积为0.24,视盘面积为0.39,但与血压共享较少的遗传结构。眼压依赖性机制与血管通透性调节途径和血管内皮功能有关,而非IOP依赖性机制往往与视网膜血管形态有关,因为16个RVF与非IOP依赖性GRS相关。

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理解不同路径作用机制有助于提升对POAG病因的理解

通过减法GWAS,研究者从POAG中减去了IOP的影响,并推导出POAG非IOP机制的GWAS,发现IOP和非IOP机制可能与不同的性状相关,并有不同的生物学表现,这可能会提升眼科医生对于POAG病因的理解。


讲题:

GWAS-by-Subtraction unveil the genetic architecture of non-IOP-dependent mechanism in POAG.

作者:

Yu Huang, Denis Plotnikov, Danli Shi, Cong Li, Xiayin Zhang, Xueli Zhang, Xianwen Shang, Shulin Tang, Zhuoting Zhu, Honghua Yu, Jeremy Guggenheim, Mingguang He

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条评论

  • Linda Gareth
    2015年3月6日, 下午2:51

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