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ARVO中国之声|减法GWAS揭示POAG非IOP依赖机制的遗传结构

2023-04-26 17:59:17
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编者按：

原发性开角型青光眼（POAG）是眼压（IOP）和非眼压依赖性机制共同作用的结果。尽管关于IOP的全基因组关联分析（GWAS）很普遍，但眼科学者们目前对除IOP以外影响POAG性状的遗传结构知之甚少。在本次ARVO会上，广东省人民医院的Yu Huang分享了团队的研究成果，该研究从POAG中减去IOP的遗传效应，以此研究POAG中剩余的非IOP依赖性机制的遗传结构。

非IOP依赖性机制常与视网膜血管形态相关

研究者使用基因组结构方程建模，评估单核苷酸多态性（SNP）与POAG变异的相关性，该变异独立于IOP，然后进行GWAS后分析。研究者构建了两个遗传风险评分（GRSs），分别代表IOP和非IOP依赖性机制，探讨了它们与泛视网膜血管形态特征（RVF）的关系。研究发现，POAG中非IOP依赖性机制的GWAS包含来自6个领先区域的15个显著的独立SNPs，总遗传率为2.1%。位于9号和14号染色体上的SNPs复制了先前在正常眼压性青光眼（NTG）上的GWAS，而其余4个区域rs80233695（编码ANAPC1）、rs12208086（编码STK38-SRSF3）、rs7803764（编码TMEM196）和rs2667477（编码RP11-384P14.1）未被报道为NTG的显著区域。与IOP依赖性机制相比，非IOP依赖机制与光学形态的遗传相关性更强，视杯面积为0.24，视盘面积为0.39，但与血压共享较少的遗传结构。眼压依赖性机制与血管通透性调节途径和血管内皮功能有关，而非IOP依赖性机制往往与视网膜血管形态有关，因为16个RVF与非IOP依赖性GRS相关。

理解不同路径作用机制有助于提升对POAG病因的理解

通过减法GWAS，研究者从POAG中减去了IOP的影响，并推导出POAG非IOP机制的GWAS，发现IOP和非IOP机制可能与不同的性状相关，并有不同的生物学表现，这可能会提升眼科医生对于POAG病因的理解。

讲题：

GWAS-by-Subtraction unveil the genetic architecture of non-IOP-dependent mechanism in POAG.

作者：

Yu Huang, Denis Plotnikov, Danli Shi, Cong Li, Xiayin Zhang, Xueli Zhang, Xianwen Shang, Shulin Tang, Zhuoting Zhu, Honghua Yu, Jeremy Guggenheim, Mingguang He

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